1、“红裤子”出身的向荣（苗侨伟饰），由当初的一名普通警察晋升至毒品调查科行动组高级督察，身边更有一班感情犹胜亲兄弟的同僚，一直以打击毒犯为己任的向荣在一年前却遇上了一件改变他一生的事。

2、当向荣带领队员前往扫毒，毒犯闻风四散，向荣等人即时展开追捕，其间一名兄弟郑志成（罗乐林饰）发现地上遗下一笔赃款，竟据为己有。志成因妻子病情恶化，需要大量金钱应急，才铤而走险。事发后向荣才得悉此事，众兄弟哀求向荣不要举报志成，他敌不过众人的苦苦哀求和兄弟间的感情，遂答应不举报兄弟曾私吞赃款一事。

3、众人以为相安无事之际，数月后向荣却接到电话，更收到电话中的影像，指志成私吞赃款一事已被拍下。要挟向荣替其办事，否则便会把所有罪证公开。不答应替他办事，向荣与众兄弟便会身败名裂，众兄弟更会因自己当初的一个错误决定而要受牢狱之苦；若答应替他办事，向荣则会一世背负“黑警”之名，永远受神秘Agent所控制。 1、《雷霆扫毒》大结局：学礼与向荣说出自己计划，原来学礼在救护车上装了炸药，要求当哥伦比亚毒贩把毒品取去时，让向荣把引爆器启动，将毒贩炸死替同僚报仇。向荣坦言看穿车上根本没有毒品，学礼此举只是想独吞毒品。双手双脚被绑在救护车内的家碧，虽看到炸药一面恐惧，但亦努力寻找方法自救。不知家碧被困在车内的向荣，正藏身在一角，手拿着引爆器正苦思如何应对。

2、哥伦比亚毒贩到达货仓，但却没有看见学礼出现。另一方面，世乐亦顺利夺得武器潜入货仓。Johnny没法联络到学礼，只好要各人上救护车，向荣仍在犹豫应否把引爆器按下时，世乐却看到向荣，更要求向荣停手。这时救护车突然发生爆炸，世乐以为是向荣引爆於是对他开枪，向荣受伤倒地，这时学礼却突然出现把向荣带走。学礼扶向荣到货仓的另一边时，向荣竟向学礼拔枪相向。

3、学礼对向荣说出自己计划后，世乐亦已追到。世乐因看见救护车被炸，认为家碧已死而激动不已，世乐责怪向荣引爆炸弹，但向荣百词莫辩。失去理智的世乐开枪射击向荣与学礼，叁人混战。学礼见世乐仍愤怒激动，即再次挑拨离间，希望世乐与向荣自相残杀，以洩自己一直以来对两人的仇恨。世乐果然中计，忍不住对向荣开枪，向荣中枪倒地，奄奄一息。

4、咏彤与众警员得希璇通知，大举赶至货仓，学礼寡不敌众匆忙走上载满大量蒸馏水的货车逃走。希璇与世乐穷追不舍，终令学礼弃车逃亡。世乐找不到学礼的行踪，却发现了学礼收藏毒品的秘密。世乐与希璇为迫学礼现身，不停开枪射击装有毒品的蒸馏水，学礼在暗处窥见一切，只恨得咬牙切齿。学礼明白警方支援已到根本无法抗衡，只好悻悻然潜逃。家碧大难不死却昏迷不醒，希璇特意到深切治疗部探望家碧，更在她面前诉说自己的心底话。

5、瑞麒等人收到学礼要潜逃离港的线报，於是安排了拘捕学礼的行动。当警方看见学礼在码头现身时，瑞麒未有在他登船时将他拘捕，反而先让学礼顺利登上船。学礼看见船驶离码头，内心刚安定下来时，却发现……家碧一直昏迷未醒，只靠仪器维持生命，直至家碧怀胎满月，医生决定替她剖腹产子，世乐一直陪伴在侧予以鼓励，希璇看见世乐仍对家碧一往情深，决定离开香港。