第1集剧情介绍：剪纸不见了
丝丝格格因为贪睡，皇上命令她到尚书房接受军训学习。入学前，柔柔遗失了深爱的剪纸，遍寻不获。另一边厢，丝丝格格无意中捡到剪纸，并将之贴满皇城。柔柔凭着一张一张剪纸的踪迹，终于找到丝丝。
第2集剧情介绍：下不来的气球
从西洋留学回来的华伦带来了许多古灵精怪的玩具，令大家感到新奇；柔柔却觉得好友丝丝被抢走，从而对他产生误解。一次华伦被困在热气球中，大家合力将他救回后，两人终于变成好友。
第3集剧情介绍：新科武状元
从外地上京赴考的白米饭高中成为本届武状元，机缘巧合下遇到丝丝、柔柔、华伦，并与三人结为好友。由于他不懂写字、年龄又太小，皇上命他前往尚书房学习，学成后才能成为正式的武状元。
第4集剧情介绍：冬菇的秘密
七夕将至，皇宫上演一套话剧《牛郎织女》，丝丝为成全冬菇小时候一段青梅竹马的感情，决定帮她找出分开已久的儿时玩伴蘑菇。最终，冬菇与蘑菇在皇宫中上演了一幕《牛郎织女》真人版。
第5集剧情介绍：愚人节的新衣
王坤为了捉弄丝丝他们，竟想到在皇宫举办一场服装秀，由尚书房的学生参加，并由柔柔全权负责。举办服装秀那天恰巧是愚人节，王坤却反被丝丝捉弄，再次成为众人笑柄。
第16集剧情介绍：勇闯大雪山
皇上生病了，丝丝她们到大雪山拿千年冰块给皇上降温，遇到了雪怪和一连串事后，终于帮助皇上拿到了。
第17集剧情介绍：灭鼠小队大作战
闹鼠灾，所有人都很烦恼，丝丝他们开始对老鼠进行驱散，最后鼠王回来了，抑制了老鼠们的这种行为。
第18集剧情介绍：动物大逃亡(上)
皇上要进行秋季狩猎，王坤为了讨好皇上，将动物抓来假装是皇上抓的，丝丝觉得动物们很可怜，于是变想了很多办法。。。。
第19集剧情介绍：动物大逃亡(下)
最后在丝丝的努力下，皇上把秋季狩猎改为了秋季郊游。皇上罚所有人去清洗狗舍。
第20集剧情介绍：男子有责
宫中要选外交员，最后被推荐的有5人，蘑菇，华伦，王坤，神经刀，武状元，最后武状元获得了胜利。
第21集剧情介绍：神探丝丝(上)
柔柔提起皇宫将有九龙壁揭幕的盛事，夜间，丝丝迫不及待去偷看九龙壁，忽然眼前略过一道黑影。丝丝被怀疑是破坏九龙壁的疑犯，顿时皇宫流言四起，丝丝与尚书房各同学决定去调查黑衣人是谁。
第22集剧情介绍：神探丝丝(下)
丝丝与尚书房的同学们查到黑衣人是神经刀，并知道了破坏九龙壁原因。此时王坤带人来拘捕丝丝等人，因为尚书房守则列明：学生不得私下调查朝廷命官。最后王坤罚丝丝等人清洁宫内所有小巷。
第24集剧情介绍：尚书房运动会(下)
丝丝羡慕皇上和神经刀在比赛中取得金牌，但因自己在运动中表现差而感到自卑。然而，皇上告诉丝丝比赛着重的是参与和发扬体育精神。丝丝最终决定参加马拉松比赛并赢得冠军。
第25集剧情介绍：蟑螂王大报复(上)
蟑螂王突然出现在皇宫，弄得人心惶惶。武状元和华伦分别用自己的方法对付蟑螂王，可惜最后还是失败。丝丝为实践对柔柔的承诺，决定去捉蟑螂，可是蟑螂王狡猾多变，几次让它逃脱。最后闹出了很多笑话！
第26集剧情介绍：蟑螂王大报复(下)
在神经刀的帮助下，丝丝捉住了蟑螂王，并跟它约定在五天内使她的朋友不再怕蟑螂，蟑螂王以后便不可出来吓人。后来丝丝对她的朋友进行了一场充满笑料的训练计划。
第27集剧情介绍：慈善卖物会
连场大雨，各地水灾为患。皇上下令皇宫节省开支，并调派宫中所有侍卫、宫女、太监到灾场协助救灾。皇上举行卖物会筹款赈灾，并命丝丝负责募捐和拍卖事宜。在卖物会中，竟有无名氏捐出十万两银票,实际上是王坤丢的。
第28集剧情介绍：好奇惹的祸
华大人从西洋买来一个望远镜送给尚书房他们用来学习天文，而丝丝和纳兰却用它偷看别人隐私，柔柔他们很生气，他们以其人之道还治其人之身也偷看别人隐私，最后他们一起受到了皇上的惩罚。
第29集剧情介绍：蟋蟀大格斗
皇宫流行新式斗蟋蟀活动，输的一方更要将自己的蟋蟀交给对方，并要接受对方给予的惩罚。王坤以权谋私，在御花园捕捉皇宫里所有强壮的蟋蟀。丝丝看不过王坤的嚣张气焰，便誓言要亲自训练一只蟋蟀来打败王坤的蟋蟀王。
第30集剧情介绍：这个冬天真太冷
养心殿内，皇上满头大汗的批阅奏章。王坤见机即从东瀛引进的一部「自动拨扇机械人」给皇上，丝丝格格与华伦听后都很感兴趣。当晚，丝丝及华伦偷偷走进昭仁殿偷看机械人。
第31集剧情介绍：动物救星
朝廷为民生大兴土木，王坤下令在野外大肆砍伐树木，动物栖息环境遭破坏，无以为家。动物们得知皇宫内有一位能与动物沟通的格格，对动物更是百般爱护，四只野生动物决定到皇宫投靠丝丝格格。
第32集剧情介绍：厨神秘方
近日皇上胃口欠佳，终日食欲不振，并出现吐泻现像。秦博士诊断皇上是患了轻微厌食症，萝卜糕甚是担忧。皇上日渐消瘦，众人担心不已，萝卜糕奋力研究袓传的食谱，希望能重振皇上的食欲。
第34集剧情介绍：可怕的麻辣嬷嬷
冬菇走后，皇太后让麻辣来照顾丝丝，麻辣嬷嬷看似对丝丝格格十分严厉，可却十分的公正。后来得知，麻辣嬷嬷小时候竟然还照顾过皇上......
第35集剧情介绍：贪玩的皇太后
皇太后很贪玩，也很孤独，因为皇上每天要忙于果实，很少有时间陪陪母亲，最后，在丝丝们的努力下，终于完成了3个不可能完成的事！皇太后非常开心!
第36集剧情介绍：超龄学生
尚书房来了一位超龄学生，叫陈铁柱，是皇上让她来的，原来他是负责观测地政的，因为以前在尚书房没毕业，来到这重新学习，最后，在丝丝的帮助下，他终于毕业了，而丝丝却给自己引来了麻烦！
第38集剧情介绍：甜心宝贝
某国的特事夫妇带着孩子来中国拜访，不过孩子却走丢了，和丝丝她们发生里许多有趣的事，最后，她们终于一家团聚了。
第39集剧情介绍：我的最佳宠物(上)
皇上送给丝丝一只叫黛丽的埃及猫，从而让她对小咪产生了讨厌，小咪很难过，想离开皇宫，最后却掉下了深坑.....
第40集剧情介绍：我的最佳宠物(下)
小咪发现黛丽也同样掉下了深坑，最后在大雪里，她们被救出来了，而黛丽也返回了埃及！
第41集剧情介绍：我的志愿
尚书房让学生们写一篇作文，写各自的志愿，丝丝因为不明白志愿是什么东西，而写不出来，最后，他终于明白了志愿是什么东西，而他却说要做一个泰山......
第42集剧情介绍：铁帽子国舅爷
在边疆的年纪小的铁帽子国舅来京城，皇上很怕他，对人很冷淡，最后在丝丝她们的感染下，变的开朗起来。
第43集剧情介绍：有教无类
苏太傅发现有些学生不听话，于是拿来了先皇赐予她的神棍，丝丝以为是要打他们，原来是要给她们讲道理，而那先不乖的学生也变乖了！
第44集剧情介绍：新年到!
学期结束，苏太傅与风将军向全部同学正式宣布年假开始。年三十晚，皇宫里面人声鼎沸、火树银花好不热闹。众文武百官、莘莘学子皆欢声笑语、载歌载舞。以麻辣嬷嬷为首等人把皇宫装饰的灯火辉煌、桃红柳绿，一片欣欣向荣的景象。
第45集剧情介绍：勇闯笑林寺(上)
丝丝一行人来到笑林寺，这里的和尚都是笑的，让她们很奇怪，武状元以为这里有秘籍，丝丝想搞明白她们为什么笑.......这时方丈出现了。
第46集剧情介绍：勇闯笑林寺(下)
她们在方丈带领下发生了许多的好玩事情，而最后他们也回去了。
第48集剧情介绍：大航海时代(下)
她们遇到了海盗，最后，在丝丝等人的帮助下，海盗们改邪归正，而朝廷的船也来了。
第51集剧情介绍：丝丝不见了
丝丝本来想和柔柔她们一起玩，可她们各有个的事情做，于是丝丝去找皇阿玛，皇上也有公文要处理，王坤让丝躲起来，让皇上去"找"，丝丝捡到了王坤的遥控器，很容易就躲起来了，最后，柔柔她们很担心丝丝，终于找到了。
第52集剧情介绍：我们毕业了
丝丝她们终于从尚书房毕业了，她们准备了一个“趴地”（派对）来感谢老师，这个趴地叫谢师宴，在谢师宴上，所有学生都准备了各自擅长的节目来表演。当她们以为可以放假的时候，没想到，还要上“上尚书房”。
