第1集剧情介绍：伏击
尤达以及三位克隆人战士前往一颗卫星执行任务，在那里他们必须面对阿萨吉·文崔斯以及她的机器人军队。
第2集剧情介绍：毒牙毕露
格里弗斯将军动用他的最新武器——毒牙号摧毁了普洛·孔的舰队。普洛·孔和三个克隆人士兵被困在逃生舱里，他必须在安纳金和阿索卡前来营救他们的同时抵挡更多战斗机器人的进攻。
第3集剧情介绍：毒牙暗影
毒牙号已经被共和国发现。安纳金和暗影中队在阿索卡和普洛·孔的陪伴下驾驶他们的远程Y翼轰炸机展开攻击行动。
第4集剧情介绍：毒牙末日
帕德梅·艾米达拉和C-3PO落进了一个陷阱，他们被格里弗斯将军俘虏上了毒牙号。仍在被格里弗斯追击中的安纳金和欧比旺现在必须登上敌舰营救议员和她的礼仪机器人。
第5集剧情介绍：新兵上阵
一队菜鸟克隆兵负责驻守里希星系的一座哨站，但他们遭到一种新式突击机器人的袭击。科迪指挥官和雷克斯上尉碰巧赶到这里帮助他们夺回这座基地——他们母星卡米诺的最后一座前哨。
第6集剧情介绍：机器人落难
携带绝地军事机密的R2-D2在一次行动中失踪，安纳金必须赶在分离主义者之前找到它。
第7集剧情介绍：机器人决斗
安纳金和阿索卡被命令摧毁格里弗斯将军的秘密敌情监听站。不顾欧比旺的反对，安纳金踏上了一个人营救R2-D2的旅程。同时，代替R2的R3-S6似乎一直在给阿索卡和雷克斯的小队帮倒忙。
第8集剧情介绍：澎湃绝地
帕德梅·艾米达拉前往罗迪亚，与她的家族世交法尔商讨食物短缺问题。不幸的是法尔已经同分离主义者做了交易。帕德梅遭到关押，营救她的重任落在了加·加·宾克斯和C-3PO肩上。
第9集剧情介绍：黑幕笼罩
卢米娜拉·昂杜里和阿索卡·塔诺押送被捕的纽特·冈雷总督前往科洛桑接受审判。杜库派遣他的徒弟带回或杀死冈雷以确保分离主义机密不会得到泄露。
第10集剧情介绍：格里弗斯之巢
基特·菲斯托跟踪刚刚逃脱的纽特·冈雷到瓦塞克星系，在那里与他的旧徒纳达尔·维布会合。但他们不知道自己到了格里弗斯将军的巢穴，此时将军因为近期的一连串失利正在被杜库伯爵测试其实力。
第11集剧情介绍：杜库被俘
欧比旺和安纳金潜入杜库伯爵的飞船试图抓住他，但他们三人最终都迫降到范科星上。正当绝地们奋力对抗一只刚达克母兽时，杜库落到了以杭多·奥纳卡为首的一支海盗团伙手中。海盗头领随后以杜库为质向共和国索要价值一百万信用点的香料作为交换。
第12集剧情介绍：冈根将军
欧比旺和安纳金以及杜库现在都成了杭多·奥纳卡的俘虏，被关押在在弗洛勒姆星球上的要塞里。加·加·宾克斯代表和卡勒斯议员携带赎金与一队护卫抵达，却发现海盗队伍中发生了叛乱。
第13集剧情介绍：绝地遇险
天行者将军在从装备有火箭包的超级战斗机器人手中营救绝地将军艾拉·塞库拉的过程中受了伤。阿索卡·塔诺将他们的飞船迫降在一颗中立行星马里登星上。那里的勒明人村民虽然不想卷入战争中，但还是愿意派一名医生去帮助安纳金。
第14集剧情介绍：和平卫士
由内莫伊迪亚人洛克·杜尔德率领的一支分离主义舰队抵达马里登星试验他们的新型灭绝武器，它能在不伤及机器的同时杀死有机生命。但他们不知道有三名绝地和两名克隆士兵因为没有离开的交通工具而被困在附近。当勒明村庄受到试验的威胁时，尽管村庄长老蒂·瓦特·卡提出异议，绝地们仍然挺身而出保卫村民。
第15集剧情介绍：非法侵入
欧比旺、安纳金和501军团的一支分遣队前往奥托普卢托尼亚行星调查发生在那里一座共和国前哨站的屠杀事件。他们不久发现了一座被相同攻击者毁灭的一座分离主义基地，而这些攻击者似乎是一支想被别人遗忘的塔尔兹人氏族。不幸的是，潘托拉高官乔宣布这颗行星处于他的人民管辖之下，命令这些多余的外星人选择主动离开或是被消灭。由于绝地不能干涉，达成和解的唯一希望落在了年轻的丘奇议员肩上。
第16集剧情介绍：内奸
安纳金和欧比旺在尝试率领共和国军解救被分离主义部队围攻的克里斯托弗星球时，发现有证据显示在共和国军内部潜伏着一名叛徒。
第17集剧情介绍：蓝影病毒
邪恶的科学家努沃·文迪在他位于纳布星球地下的秘密实验室里研制出一种可怕的蓝影病毒。当他抓到艾米达拉议员和宾克斯代表时，绝地将军天行者和克诺比展开了营救行动。
第18集剧情介绍：千月之谜
致命的蓝影病毒在文迪的地下实验室里泄露出来，而此时帕德梅、阿索卡、加·加和一些克隆人士兵仍被困在里面。安纳金和欧比旺只有48小时的时间找到解药。他们前往耶果卫星，但将会发现要想离开就必须花费大力气尝试越过“德罗尔的幽灵”。
第19集剧情介绍：赖洛思风暴
分离主义者入侵了提列克人的母星赖洛思。安纳金和阿索卡带领一支战斗机中队对抗一艘由内莫伊迪亚舰长马尔·图克指挥的贸易联盟战舰。
第20集剧情介绍：赖洛思百姓
在赖洛思战役期间，欧比旺、科迪指挥官和他的第212攻击营出动解放被占领的提列克村庄纳巴特。两名克隆人蜡匠和沸腾找到了一个叫做努玛的小女孩，而她将在克诺比的计划中发挥作用。
第21集剧情介绍：赖洛思解放
梅斯·温杜和他的克隆人士兵准备解放提列克首都莱苏，但他需要取得一支由查姆·辛杜拉率领的起义军的帮助来实现这一目标。
第22集剧情介绍：人质危机
凯德·贝恩召集了一支由他的赏金猎人同行组成的团队，控制了议会大厦。他们计划用那里的人质交换犯罪头子赫特人齐罗出狱。安纳金·天行者是此时议会大厦里的唯一绝地，但他却发现他把光剑忘在了帕德梅·艾米达拉那里。
