该剧以单元形式展开讲述女法医“JD宋安妍”（蔡卓妍 饰）在“死因解码研究所”的遭遇为线索，协助警方破获一个个诡异案件，同时试图探寻父亲旧案的真相，并与热血探员刘志明（张孝全 饰）之间展开的一系列惊心动魄的故事。

JD宋安妍”因患HSP“高敏症”而拥有极高敏感度的大脑，不由自主全天候接收一切资讯，在不堪其扰的同时也屡次凭借信息储备量非凡的“最强大脑”打开线索关窍，解开悬案谜题。

剧中蔡卓妍饰演女主角JD，是就职于商业机构的法医，JD在专业用语中意指“无名氏，她的真名叫宋安妍，之所以JD为名，与角色神秘的身世有关。

二十年前宋安妍的法医父亲被指控杀死了包括妻子在内的多名受害人后潜逃，宋安妍也至此失去踪迹，但实际上宋安妍在父亲的安排下隐姓埋名进入孤儿院。

长大后的JD成为职业法医，一边受雇于委托人协助查案，一边默默调查父亲旧案，在查案过程中，她遇到了同样身世神秘的林小美（钟欣潼饰）。

林小美出场时看起来很温柔，像一个偏执敬业却被人利用、陷害的音乐老师，但校园暴力案件谜题解开后，观众会发现她内里相当疯狂、残酷。

无论是演员戏里戏外的反差感，还是TWINS“互撕”的冲击力，亦或角色之间的戏剧张力都相当充足，也将《女法医JD》剧本推向了一个小巅峰。