1、西汉时期，八岁的刘弗陵隐瞒身份随行游览到万里荒漠，走投无路之际，一个骑天山雪驼的绿衫女孩云歌凭空降临，将其带出荒漠。冷漠似冰的刘弗陵最终被精灵可爱的云歌打动，互赠礼物后相约十年后的长安相会。
2、十年后，云歌带着儿时的诺言来到长安寻找刘弗陵，未想却将刘病已误认为是儿时的陵哥哥，以为他不仅不记得儿时的大漠诺言，而且身边还多了个贤惠美丽的女子许平君。伤心的云歌正欲返回西漠，却遇上了翩翩公子孟珏。
3、萍水相逢的孟珏为云歌排忧解难，看似淡漠，却以独特的方式默默守候云歌。原来，八岁的云歌无意中送出两只珍珠绣鞋，一是与她拉钩为誓的刘弗陵，另一就是当年的小乞丐孟珏。云歌费尽心思找寻刘弗陵，却机缘巧合地与孟珏相识相爱。珍珠绣鞋牵引出两段情缘，看似造化弄人，却是上天给云歌最好的礼物。
4、云歌从一个无忧无虑的少女到经历了人生的悲欢离合，但她依然是大漠上骑着天山雪驼爱乐于助人给人希望的善良女孩，努力与坚持在真爱中，做出最美味的食物，在蓝天白云下，唱出最美最动人的歌。

《云中歌》是由桐华的同名小说改编而成，其对原著小说作了一些改动，包括大结局。电视剧版的大结局是刘病已痛失皇后许平君，后又除掉权倾朝野的霍家。关于云歌与孟珏的结局，电视剧表达地特别模糊。但我认为，皇上最后并没有杀孟珏，孟珏最后还是去到大漠寻找云歌，并与云歌厮守到老。

皇后许平君突然感觉肚子痛，皇上急忙请太医为皇后诊治。太医告诉皇上，皇后恐怕要早产且情况十分危急。皇后感觉自己快不行了，她想见云歌最后一面，于是叫人去请云歌。云歌来后，她告诉云歌关于钩吻花一事并非孟珏所为。随后，她在皇上面前断气。自皇后死后，皇上伤心不已，整天醉生梦死。后因太子虎儿的安慰，他振作了起来，并查明皇后是因霍成君陷害致死。云歌知道钩吻花一事的真相后，打算放下对孟珏的仇恨。她最终决定回到大漠。在回大漠的路上，孟珏突然追赶上来，最后他许诺自己一定会去找云歌。

两年后，霍大将军凯旋而归，皇上亲自到城门迎接，他还许诺晚上在未央宫设宴为霍将军接风洗尘。霍将军没想到的是，这场宴会竟是一场鸿门宴。从宴会回到家后，他便倒地身亡。听到父亲已死消息的霍成君当场晕厥，她的母亲来到宫中看望她。为了让成君当上皇后，她让霍成君假装怀孕获得皇上的宠爱。但没想到的是，皇上揭穿了她们的谎言，并将霍成君打入冷宫。为了替皇后报仇，皇上赐霍成君白绫，最后还好孟珏及时赶到才救下霍成君。

认为自己以完成所有的孟珏打算离开朝廷去大漠寻找云歌，知道此事的皇上坚决不肯。在孟珏出宫之时，皇上带领弓箭手严阵以待，他扬言孟珏只要敢踏出宫门一步，他将会让孟珏万箭穿心。固执的孟珏不为所动，坚定地迈开了出宫的脚步。皇上也在此时拉开了弓。

远在大漠的云歌站在高处，将手中的丝带抛向空中。漂浮在空中的丝带化作莲形飞向孟珏手中。自此，《云中歌》就大结局了。从这最后的情节看来，云歌最后还是和孟珏终成眷属了。