因为好奇，丁瑶转动了父亲考古时带回来的古代南越国至尊之宝——九星轮。不料九星轮突然发出异彩，霎那间天昏地暗、风云变色、电闪雷鸣，形成强大的气流，将丁瑶卷入超时空漩涡中。
丁瑶醒来的时候，发现自己置身古洞，身旁有一个被铁链锁着的英俊少年。丁瑶还未弄清楚发生了什么事，就被冲进来的守洞士兵抓获。
丁瑶这才明白自己转动了九星轮，进入和时光隧道，回到三千年前的南越国，南越国大祭祀腾蛇以擅闯皇家禁地之罪要将她处死，危急时刻，南越王荣狄赶到。
盘古开天、洪荒伊始。大地之母女娲黏土造人、繁衍后代、造福人间。谁知火神祝融与水神共工争斗，共工头撞不周山，使得天体倾斜，三界大乱，妖孽趁机横行无忌，危害人间。
上古四大神兽——青龙、白虎、朱雀、玄武各霸一方，逞凶作乱。四大神兽秉性各异，龙族高傲、白虎卤莽、玄武阴毒、唯朱雀最为残忍，每日要吃人度日。共工氏头撞不周山，三界混乱，朱雀趁机煽动三大神兽联手祸害人间。女娲用补天遗留的十二块五彩石铸造镇妖瓶，并在另外四只灵兽麒麟、白矖、腾蛇、白泽(独角兽)的帮助下，战败以朱雀为首的四大神兽，除白虎、斩玄武、降朱雀、收服龙族。终使人间恢复和平。女娲功德圆满，由白矖、腾蛇两大护法接引上天，被尊为上古第一大神。
获封神位的朱雀神君心存不甘，自封幽冥鬼帝，再度为祸人间。世人在享受短暂太平后，各部落首领亦欲望膨胀，为争夺利益互相杀戮，女娲遂派两大护法白矖、腾蛇下凡寻宝除妖、拯救人间。 “白矖”与“腾蛇”因为除妖有功，得到万民爱戴；任务完成后，白矖留恋人间的美景，不愿再返天庭，于是“白矖”留在了美丽的南越国，成为南越国的女祭祀，她与师妹腾蛇一起降妖布道，拯救苍生造福社稷；恩泽一方，使人间出现一片安宁。
南越王朝历尽数代不衰，全仗白矖、腾蛇全力辅佐。却不料，新一任南越王荣狄继位，参拜圣庙时偶然目睹白矖(仙乐)真容，惊为天人，欲纳为后，白矖为避荣狄纠缠，将大祭祀之位传给腾蛇，自己躲入南越古洞，再不踏入尘世一步。
虽说如此，荣狄并没有忘却白矖。他对白矖的爱恋，点燃了腾蛇内心的嫉妒之火，因为她深深的爱着荣狄。可是荣狄的忽视让她失去理智，开始了不择手段报复之旅。她痛恨白矖，她发誓，自己得不到的幸福，白矖也不能够得到。当她发现古洞中的问天和白矖互相爱慕，诡计悄然入心。
丁瑶（钟欣潼饰）22岁，考古学家丁勉博士的女儿，容貌、资质平常，什么都很平常却开朗乐观。丁瑶本为上古大神女娲座前左护法白矖（仙乐）转世，丁勉教授从南越古洞里挖出当年祭祀问卦用的九星轮，丁瑶在帮父亲做研究课题时误入九星轮，结果穿越时空回到了三千年前，并在古洞里遇到了被封印的问天。她救下问天的同时得到能够令天下群妖丧胆的镇妖瓶，引得各路妖魔前来抢夺，混乱中，镇妖瓶破碎，化为12颗灵珠散落四方，引得三界震动，丁瑶为弥补自己的过失，毅然决定与问天一起去寻找十二颗灵珠。一场前世今生的恋情就此展开。
仙乐（钟欣潼饰）上古大神女娲左护法白矖，下凡转世为仙乐，腾蛇（魔音）师姐，南越国女祭司。其是女娲传人，心怀慈悲，眼见上古年间，人间混乱，妖魔为祸，她毅然恳请天帝让自己下界拯救苍生！仙乐下界除妖，在女娲神殿请出镇妖瓶，终平三界之乱，使人间恢复太平。仙乐留恋人间，于是请旨永驻人间，成为南越国大祭司！仙乐一直为人间驱除妖魔，拯救苍生，直到一天她遇见了问天，仙乐第一次尝到了爱情的滋味，正当她准备放弃神籍，与问天长相厮守时，阴谋发生了。她和问天因为遭人陷害互相残杀，含恨而终，其复活后消灭妖魔最终重登神位。
问天（蒲巴甲饰）上古四大神兽龙族后裔，半人半龙。是父亲苍龙与一凡间蜀国公主所生，由于他有一半的妖族血统及一半的人类血统，故为人类与妖族所不容，自幼遭尽白眼，问天亲眼看着母亲被人杀害，幼小的他发誓要成为强大的妖精。于是他苦苦追寻上古大神女娲左护法白矖（仙乐），准备夺得镇妖瓶，连翻追逐与争斗中，问天与白矖渐渐产生了情感，对对方心生爱慕，问天愿为了白矖而变成人，却不料一场阴谋伴随而来，问天被封印，仙乐（白矖）重伤而亡。三千年后，仙乐（白矖）的转世丁瑶误入九星轮，穿越时光来到被封印的问天身边，一场千年之恋就此拉开帷幕！
腾蛇（魔音）（刘庭羽饰）上古大神女娲右护法腾蛇，下凡转世为魔音，仙乐（白矖）师妹，后为南越国女祭司。使用兵器：九弦琴其一直嫉妒仙乐的美丽与法力，认为仙乐抢走了自己的心上人，为情所困的腾蛇（魔音）遁入了魔道，与幽冥鬼帝（朱雀神君）联手，陷害问天，重伤仙乐，结果仙乐（白矖）临死前将镇妖瓶与问天一同封印，只等有缘之人到来，重新开启镇妖瓶，拯救苍生，其最后为救荣狄而死且重登神位。
荣狄（谭耀文饰）南越国王。使用兵器：天子剑南越规矩，新一代国王登基前，必须前去圣庙参拜，由大祭祀运用九星轮占卜未来的吉凶。荣狄却对大祭祀仙乐（白矖）一见钟情，一再表示要娶她为后！一直暗恋荣狄的腾蛇（魔音）大为光火，于是设计陷害仙乐（白矖），施法术迷惑荣狄，可无论她无何做，荣狄心中始终不能忘怀仙乐（白矖），事后其因情而归隐古墓。
慕莲（郭珍霓饰）南越巫女。使用兵器：金刚伞（一般的时候用伞里的剑）其家族世代守护女娲陵墓---镇妖瓶乃女娲所铸，用来震慑四方妖孽！幽冥鬼帝（朱雀神君）为夺镇妖瓶及女娲神卷，杀害慕莲一族，为报血海深仇，慕莲与问天、丁瑶、无道等人联手，准备寻回十二灵珠，重铸镇妖瓶，为世间铲除妖患，事后其成为南越女王。
时幽冥（孙兴饰）上古四大神兽之朱雀神君下凡，化身时幽冥，自封鬼帝，其外表看起来和蔼儒雅，其实内心阴险狡诈；不发怒的时候平和可亲；发怒的时候阴冷可怕。上古时代，幽冥鬼帝（率领群妖为祸三界，由女娲左护法仙乐（白矖）转世的仙乐降服，仙乐一时恻隐没有杀他！幽冥鬼帝对仙乐（白矖）由感激转为爱慕，可仙乐（白矖）一再表示自己不会在凡间动情，尤其不会对妖怪动情！仙乐爱上问天后，幽冥鬼帝暴跳如雷，于是当因爱生妒的腾蛇（魔音）找上幽冥鬼帝时，二人一拍即合，阴谋陷害问天与仙乐（白矖），抢夺镇妖瓶，意在号令三界，最终其失败而亡。
无道（蒋毅饰）上古四大神兽龙族殿下，问天同父异母之兄，为苍龙长子，纯正的龙族血统！所以无道冷酷无情，视人命如同草芥！无道认为，自己一生的耻辱就是有一个半人半妖的弟弟问天，而且他觉得父亲似乎十分偏向这个弟弟！这是无道不能原谅的，我是长子且血统纯正，为什么不把龙族圣物留给我？所以兄弟俩的关系十分恶劣！无道无时无刻都想杀问天夺三叉戟，可无道坚信一条---问天为我龙族后裔，可取他性命者，只有我这个哥哥，旁人若有伤害问天者，等于是对我无道（一般都说是对我龙族无道的挑衅）的挑战，最终二人和解且其了解了爱为何物！
雨蝶（李倩饰）蜀国公主。使用兵器：咒怨魔镜（幽冥鬼帝（朱雀神君）所给）其因为逃婚而私自逃离蜀国，偶然救下受伤的无道，一颗心被无道所迷，无论他是人是妖，都毅然决定追随于他。其性格活泼，敢爱敢恨。最后雨蝶因中时幽冥妖气而亡，死后化成蝴蝶，跟无道一龙一蝶云游四海。
听琴（朱紫汶饰）腾蛇（魔音）首席弟子。使用兵器：琵琶其自幼是孤儿，由腾蛇（魔音）收养，对腾蛇（魔音）、对南越始终忠心耿耿。对腾蛇（魔音）的一些所作所为十分看不惯，可碍于师徒情谊，无法表露，后腾蛇（魔音）投靠魔族，自此与腾蛇（魔音）决裂，站到问天和丁瑶一边，事后其成为新一任女祭司，与新一任大江寒一同辅佐慕莲女王。
胡姬（刘娜萍饰）魔族掌旗使，性感妩媚的狐妖。使用兵器：羽扇其本是三山五岳得道的精灵，幽冥鬼帝（朱雀神君）自封鬼帝，不得不被迫为他效命，一直寻求机会时幽冥，后得卫辽相助，终于赶走幽冥鬼帝（朱雀神君），成为魔族女王……幽冥鬼帝（朱雀神君）伤好后重新得回幽冥宫，并将她的心取走，以做要挟！自心被拿走的一刻起，胡姬誓与幽冥鬼帝（朱雀神君）不共戴天，最终其惨死。
《女娲传说之灵珠》剧情简介
盘古开天，洪荒伊始。火神祝融与水神共工为争夺帝位展开恶战，共工氏兵败，为泄心头之恨头撞不周山，使得天体倾斜，三界大乱，妖孽趁机横行无忌，危害人间。女娲即派左右护法白矖、腾蛇化名下凡，寻宝除妖、补天治水、拯救苍生、普度人间。白矖被人间真情所动，与少年问天暗生情愫。腾蛇因妒生恨，阴谋陷害二人，致使白矖与问天相互误会，
最终未果，在民间留下一段旷世神恋的佳话，千古轮回，唯有爱情永恒。白矖再度转世为人间少女，对那段民间传说心向往之，为了憧憬那段跨越千年的爱情，她机缘巧合、激情穿越、巧遇爱人、再续前缘，大地之母女娲补天造人、斩妖除魔的故事一直流传至今。